AT3G49700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.994 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes a a member of the 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) synthase (S-adenosyl-L-methionine methylthioadenosine-lyase, EC 4.4.1.14) gene family. Mutants produce elevated levels of ethylene as etiolated seedlings. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase 9 (ACS9); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase (InterPro:IPR001176), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Aminotransferase, class I/classII (InterPro:IPR004839), Aminotransferases, class-I, pyridoxal-phosphate-binding site (InterPro:IPR004838), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2 (InterPro:IPR015422); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ACC synthase 5 (TAIR:AT5G65800.1); Has 32525 Blast hits to 32522 proteins in 2971 species: Archae - 868; Bacteria - 22571; Metazoa - 692; Fungi - 768; Plants - 1328; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6298 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:18434470..18436141 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53172.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.31 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 470 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKQLSRKVTS NAHGQDSSYF LGWEEYEKNP YDEIKNPNGI IQMGLAENQL CFDLIETWLA KNPDAAGLKK DGQSIFKELA LFQDYHGLPE FKKALAEFME 101: EIRGNRVTFD PSKIVLAAGS TSANETLMFC LAEPGDAFLL PTPYYPGFDR DLKWRTGAEI VPIHCSSSNG FQITESALQQ AYQQAQKLDL KVKGVLVTNP 201: SNPLGTMLTR RELNLLVDFI TSKNIHLISD EIYSGTVFGF EQFVSVMDVL KDKNLENSEV SKRVHIVYSL SKDLGLPGFR VGAIYSNDEM VVSAATKMSS 301: FGLVSSQTQY LLSALLSDKK FTSTYLDENQ KRLKIRQKKL VSGLEAAGIT CLKSNAGLFC WVDMRHLLDT NTFEAELELW KKIVYDVKLN ISPGSSCHCT 401: EPGWFRVCFA NMSEDTLDLA MKRLKEYVES TDSRRVISKS SHDRIKSLRK RTVSNWVFRV SWTDRVPDER |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)