AT3G49470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.993 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-like protein 2 (NACA2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal (InterPro:IPR000449), Nascent polypeptide-associated complex, alpha subunit (InterPro:IPR016641), Nascent polypeptide-associated complex NAC (InterPro:IPR002715); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nascent polypeptide-associated complex (NAC), alpha subunit family protein (TAIR:AT4G10480.1); Has 1390 Blast hits to 1373 proteins in 295 species: Archae - 27; Bacteria - 8; Metazoa - 613; Fungi - 295; Plants - 175; Viruses - 7; Other Eukaryotes - 265 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:18341072..18342273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23713.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 217 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSPPPAVVTE SADGQPEQPP VTAIAEELEK KLQTDEPIVE DVKDDEDDDD DDEEEEDDDA QGVSGSSKQS RSEKKSRKAM LKLGMKPVTG VSRVTIKRTK 101: NVLFFISKPD VFKSPHSETY VIFGEAKIED LSSQLQTQAA QQFRMPEIGA TSQRAEASTA TVEAQVEEDE EEIDETGVEA RDIDLVMTQA GVSRSKAVKA 201: LKSHDGDIVS AIMELTT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)