AT3G49360.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.903 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : 6-phosphogluconolactonase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
6-phosphogluconolactonase 2 (PGL2); FUNCTIONS IN: 6-phosphogluconolactonase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: pentose-phosphate shunt, carbohydrate metabolic process; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase (InterPro:IPR006148), 6-phosphogluconolactonase, DevB-type (InterPro:IPR005900); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: 6-phosphogluconolactonase 4 (TAIR:AT5G24410.1); Has 3175 Blast hits to 3174 proteins in 1222 species: Archae - 0; Bacteria - 2096; Metazoa - 177; Fungi - 256; Plants - 156; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 490 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:18303189..18304283 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28864.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 259 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAPVKRRVFK TNNEMAVELA KYTADLSSKF CKERGVFTVV LSGGDLIAWL WKLLEAPYID SIEWSKWHIF WVDERVCAWD HADSNYKLAY DGFLSKVPVP 101: AENIYAIDNG LGAEGNAELA AERYEECLKQ KVNQNIIRTY KSSGFPQFDL QLLGMGPDGH MASLFPGHAQ INEKVKWVTS ITDSPKPPSK RITLTLPVIN 201: CASYNVMAVC DKEQADSVAA ALNHTKDLPA GRLTADVEVV WFLDQAAASK LPHGWCSIL |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)