AT3G49110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 ASURE: extracellular What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : peroxidase CA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Class III peroxidase Perx33. Expressed in roots. Located in the cell wall. Involved in cell elongation. Expression activated by light. May play a role in generating H2O2 during defense response. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
peroxidase CA (PRXCA); FUNCTIONS IN: peroxidase activity; INVOLVED IN: oxygen and reactive oxygen species metabolic process, response to light stimulus, defense response to bacterium, defense response to fungus, unidimensional cell growth; LOCATED IN: vacuole, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: stem, root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Plant peroxidase (InterPro:IPR000823), Peroxidases heam-ligand binding site (InterPro:IPR019793), Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial (InterPro:IPR002016), Peroxidase, active site (InterPro:IPR019794); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: peroxidase CB (TAIR:AT3G49120.1); Has 4322 Blast hits to 4294 proteins in 227 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 3; Fungi - 31; Plants - 4239; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 49 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:18200713..18202891 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38943.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 354 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQFSSSSITS FTWTVLITVG CLMLCASFSD AQLTPTFYDT SCPTVTNIVR DTIVNELRSD PRIAGSILRL HFHDCFVNGC DASILLDNTT SFRTEKDALG 101: NANSARGFPV IDRMKAAVER ACPRTVSCAD MLTIAAQQSV TLAGGPSWKV PLGRRDSLQA FLDLANANLP APFFTLPQLK ANFKNVGLDR PSDLVALSGA 201: HTFGKNQCRF IMDRLYNFSN TGLPDPTLNT TYLQTLRGQC PRNGNQSVLV DFDLRTPLVF DNKYYVNLKE QKGLIQSDQE LFSSPNATDT IPLVRAYADG 301: TQTFFNAFVE AMNRMGNITP TTGTQGQIRL NCRVVNSNSL LHDVVDIVDF VSSM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)