AT3G48560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : chlorsulfuron/imidazolinone resistant 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Catalyzes the formation of acetolactate from pyruvate, the first step in valine and isoleucine biosynthesis. Requires FAD, thiamine pyrophosphate and Mg. Inhibited by the sulphonylurea herbicide, chlorsulphuron, and the imidazolinone herbicide, imazapyr. The obtained crystal structure of acetohydroxyacid synthase AHAS, EC 2.2.1.6)in complex with herbicides of the sulphonylurea and imidazolinone family reveals the molecular basis for substrate/inhibitor binding. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
chlorsulfuron/imidazolinone resistant 1 (CSR1); FUNCTIONS IN: acetolactate synthase activity, pyruvate decarboxylase activity; INVOLVED IN: branched chain family amino acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: TPP-binding enzyme, conserved site (InterPro:IPR000399), Thiamine pyrophosphate enzyme, central domain (InterPro:IPR012000), Acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic (InterPro:IPR012846), Thiamine pyrophosphate enzyme, N-terminal TPP-binding domain (InterPro:IPR012001), Thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP-binding (InterPro:IPR011766); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Thiamine pyrophosphate dependent pyruvate decarboxylase family protein (TAIR:AT5G17380.1); Has 30963 Blast hits to 30605 proteins in 2694 species: Archae - 488; Bacteria - 17421; Metazoa - 266; Fungi - 871; Plants - 599; Viruses - 25; Other Eukaryotes - 11293 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:18001530..18003542 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 72589.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 670 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAATTTTTT SSSISFSTKP SPSSSKSPLP ISRFSLPFSL NPNKSSSSSR RRGIKSSSPS SISAVLNTTT NVTTTPSPTK PTKPETFISR FAPDQPRKGA 101: DILVEALERQ GVETVFAYPG GASMEIHQAL TRSSSIRNVL PRHEQGGVFA AEGYARSSGK PGICIATSGP GATNLVSGLA DALLDSVPLV AITGQVPRRM 201: IGTDAFQETP IVEVTRSITK HNYLVMDVED IPRIIEEAFF LATSGRPGPV LVDVPKDIQQ QLAIPNWEQA MRLPGYMSRM PKPPEDSHLE QIVRLISESK 301: KPVLYVGGGC LNSSDELGRF VELTGIPVAS TLMGLGSYPC DDELSLHMLG MHGTVYANYA VEHSDLLLAF GVRFDDRVTG KLEAFASRAK IVHIDIDSAE 401: IGKNKTPHVS VCGDVKLALQ GMNKVLENRA EELKLDFGVW RNELNVQKQK FPLSFKTFGE AIPPQYAIKV LDELTDGKAI ISTGVGQHQM WAAQFYNYKK 501: PRQWLSSGGL GAMGFGLPAA IGASVANPDA IVVDIDGDGS FIMNVQELAT IRVENLPVKV LLLNNQHLGM VMQWEDRFYK ANRAHTFLGD PAQEDEIFPN 601: MLLFAAACGI PAARVTKKAD LREAIQTMLD TPGPYLLDVI CPHQEHVLPM IPSGGTFNDV ITEGDGRIKY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)