AT3G48320.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.988 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
putative cytochrome P450 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 21 (CYP71A21); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: oxidation reduction; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 71, subfamily A, polypeptide 22 (TAIR:AT3G48310.1); Has 32159 Blast hits to 31925 proteins in 1622 species: Archae - 46; Bacteria - 2978; Metazoa - 11709; Fungi - 6921; Plants - 9489; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 1013 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:17891241..17892804 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55611.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 490 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESMTMIILQ SLIIFITILF FKKQKRGKKS NTPRSPPRLP LIGNLHQLGH HPHRSLCSLS HRYGPLMLLH LGRVPVLVVS SADVARDILK THDRVFASRP 101: RSKLFEKLFY DGRDVAFAPY GEYWRQIKSV CVLRLLSNKM VTSFRNVRQE EISLMMEKIQ KSSSLQVNVS ELLGSLTNDV ISRIALGRKY SGETDSKELM 201: KRLMMLMGEF SVGTYVPWLG WIDWISGLDG QLNKTGNDLD EFLEKVVQDH VDGDGQRTDF VDVLLRIQRE KSIGFEIDRL CIKAIVLDVL VAGTDSSYAL 301: MDWAMTELLR HPECLRTLQE EVRTICKGNL SVSEEDIQNM SYLKAVIKET TRLHPPLPLL APHESIQDVI LGDYHIPAGT QVMINAWAIG REAATWGPDA 401: EKFRPERHLD SSVDFRGHNF ELVPFGAGRR ICPAISFAVV LIEVALANFV HRYDWKLPED SKENQTNVAE STGMVIHRLF PLYAIASSTT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)