AT3G48090.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Component of R gene-mediated disease resistance in Arabidopsis thaliana with homology to eukaryotic lipases. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
enhanced disease susceptibility 1 (EDS1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, class 3 (InterPro:IPR002921); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT3G48080.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:17755553..17757292 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59596.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.99 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 515 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVRSRKQIV FTGHSSGGAT AILATVWYLE KYFIRNPNVY LEPRCVTFGA PLVGDSIFSH ALGREKWSRF FVNFVSRFDI VPRIMLARKA SVEETLPHVL 101: AQLDPRKSSV QESEQRITEF YTRVMRDTST VANQAVCELT GSAEAFLETL SSFLELSPYR PAGTFVFSTE KRLVAVNNSD AILQMLFYTS QASDEQEWSL 201: IPFRSIRDHH SYEELVQSMG KKLFNHLDGE NSIESTLNDL GVSTRGRQYV QAALEEEKKR VENQKKIIQV IEQERFLKKL AWIEDEYKPK CQAHKNGYYD 301: SFKVSNEEND FKANVKRAEL AGVFDEVLGL MKKCQLPDEF EGDIDWIKLA TRYRRLVEPL DIANYHRHLK NEDTGPYMKR GRPTRYIYAQ RGYEHYILKP 401: NGMIAEDVFW NKVNGLNLGL QLEEIQETLK NSGSECGSCF WAEVEELKGK PYEEVEVRVK TLEGMLGEWI TDGEVDDKEI FLEGSTFRKW WITLPKNHKS 501: HSPLRDYMMD EITDT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)