AT3G46120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purple acid phosphatase 19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
purple acid phosphatase 19 (PAP19); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine phosphatase activity, acid phosphatase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: flower; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Purple acid phosphatase-like, N-terminal (InterPro:IPR008963); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: purple acid phosphatase 11 (TAIR:AT2G18130.1); Has 1514 Blast hits to 1503 proteins in 302 species: Archae - 1; Bacteria - 342; Metazoa - 182; Fungi - 81; Plants - 741; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 167 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:16935921..16939766 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44055.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.46 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 388 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGLNHLTLVC SAIALLSIFV VSQAGVTSTH VRVSEPSEEM PLETFPPPAC YNAPEQVHIT QGDHAGRGMI ISWVTPLNED GSNVVTYWIA NSDGSDNKSA 101: LATTSSYRYF NYTSGYLYHA TIKGLETLYN YMSNPKGQAV LFAGDLSYAD DHPNHDQRKW DSYGRFVEPS AAYQPWIWAA GNHEIDYAES IPHKVHLHFG 201: TKSNELQLTS SYSPLTQLMD ELKKVNRSET PWLIVLVHAP WYNSNNYHYM EGESMRVTFE PWFVENKVDI VFAGHVHAYE RSERISNIQY NITDGMSTPV 301: KDQNAPVYIT IGDGGNIEGI ANNFIDPQPS YSAFREASFG HAILEIKNRT HAHYTWHRNK EDEFIPEAVI ADSIWLKNRY YLREEETS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)