AT3G43660.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Vacuolar iron transporter (VIT) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Vacuolar iron transporter (VIT) family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF125, transmembrane (InterPro:IPR008217); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Vacuolar iron transporter (VIT) family protein (TAIR:AT3G43630.1); Has 1844 Blast hits to 1835 proteins in 644 species: Archae - 71; Bacteria - 1261; Metazoa - 0; Fungi - 84; Plants - 213; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 215 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:15565332..15565928 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 20944.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 198 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESNNNNLNL DMEKDQETTF DYSKRAQWLR AAVLGANDGL VSTASLMMGI GAVKQDVRIM LLTGFAGLVA GACSMAIGEF ISVYSQYDIE VAQMKRESGG 101: ETKKEKLPSP TQAAIASALA FTLGAIVPLL AAAFVKEYKV RIGVIVAAVT LALVMFGWLG AVLGKAPVVK SLVRVLIGGW LAMAITFGFT KLVGSHGL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)