AT3G32040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Terpenoid synthases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Terpenoid synthases superfamily protein; INVOLVED IN: isoprenoid biosynthetic process; EXPRESSED IN: root; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Polyprenyl synthetase-related (InterPro:IPR017446), Terpenoid synthase (InterPro:IPR008949), Polyprenyl synthetase (InterPro:IPR000092); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Terpenoid synthases superfamily protein (TAIR:AT3G29430.1); Has 16611 Blast hits to 16604 proteins in 2939 species: Archae - 342; Bacteria - 9430; Metazoa - 266; Fungi - 381; Plants - 459; Viruses - 13; Other Eukaryotes - 5720 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:13047822..13049009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38938.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 360 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANTVHLSSS SLFIQTRGRK YNSILSFNNL QKRTVLSLSC ALTSQGGKDM IPPKGKSNDR NFAFDFKSYM IRKAESVSMA LNVSVPPQDP LAIQEAVRYS 101: LLAGGKRVRP LLCIAACELV GGDEATAMSA ACAVEMIHTS SLIHDDLPCM DDADLRRGKP TNHKVFGEHM AVLAGDALLA LAFEHMTVVS SGLVAPERMI 201: RSVTELAKAI GTKGLVAGQV SDLCSQGLNP YDVGLERLEF IHLHKTAALL EAAAVLGAII GGGTEEEIQK LRKYGRCIGL LFQVVDDIID VTESTEELGK 301: TAGKDVMARK LTYPRLIGLE RSREVAEKLR REAAEQLLGF DSNKVAPLVA LASYIACRHN |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)