AT3G30290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.985 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 702, subfamily A, polypeptide 8 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
a member of cytochrome P450 gene family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 702, subfamily A, polypeptide 8 (CYP702A8); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, E-class, group IV (InterPro:IPR002403), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 702, subfamily A, polypeptide 2 (TAIR:AT4G15300.1); Has 26410 Blast hits to 26360 proteins in 1480 species: Archae - 48; Bacteria - 3537; Metazoa - 10238; Fungi - 4408; Plants - 7158; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 1015 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:11917230..11919546 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47047.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.36 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 408 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDRFFRTSLF GGKVIISMDN ELNMEMAKTN RTPGITKSIA RLFGEDNNLF LQSTESHKHV RNLTVQMLGS QSLKLRIMEN IDLLTRTHME EGARDGSLDV 101: KETTSKILIE CLAKKVMGEM EPEAAKKLAL CWRYFPSGWF RLPFNLPGIG VYNMMKARKR MKTLLKEEVL KKREAGEEFG EFSKIIFGEK EGEKETMSMK 201: NVIEYIYTFF VIANETTPRI LAATVKFISE NPKVMQELQR EHAMIFENKS EEAGLTWEDY KSMTFTNMVI NESLRISTTV PVILRKPDHD TKVGDYTIPA 301: GWNFMGYPSA HFDPTKYEDP LEFNPWRWKG NDLDAIVSTN YIPFGAGPRL CVGAYFAKLL MAIFIHHLCR YRWSMKAEVT VTRSYMLMFP RGCDVQISKD 401: TQEHDSDG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)