AT3G29200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : chorismate mutase 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
L-ascorbate peroxidase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
chorismate mutase 1 (CM1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Chorismate mutase, type II (InterPro:IPR020822), Chorismate mutase, AroQ class, eukaryotic type (InterPro:IPR008238); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: chorismate mutase 3 (TAIR:AT1G69370.1); Has 278 Blast hits to 278 proteins in 116 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 0; Fungi - 142; Plants - 118; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 16 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:11164582..11166258 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38240.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 340 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEASLLMRSS CCSSAIGGFF DHRRELSTST PISTLLPLPS TKSSFSVRCS LPQPSKPRSG TSSVHAVMTL AGSLTGKKRV DESESLTLEG IRNSLIRQED 101: SIIFGLLERA KYCYNADTYD PTAFDMDGFN GSLVEYMVKG TEKLHAKVGR FKSPDEHPFF PDDLPEPMLP PLQYPKVLHF AADSININKK IWNMYFRDLV 201: PRLVKKGDDG NYGSTAVCDA ICLQCLSKRI HYGKFVAEAK FQASPEAYES AIKAQDKDAL MDMLTFPTVE DAIKKRVEMK TRTYGQEVKV GMEEKEEEEE 301: EGNESHVYKI SPILVGDLYG DWIMPLTKEV QVEYLLRRLD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)