AT3G27620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alternative oxidase 1C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes an isoform of alternate oxidase. expressed in all tissues examined and expression is not induced by antimycin A, an inhibitor of complex III in the mitochondrial respiratory chain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
alternative oxidase 1C (AOX1C); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alternative oxidase (InterPro:IPR002680); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alternative oxidase 1B (TAIR:AT3G22360.1); Has 1310 Blast hits to 1304 proteins in 245 species: Archae - 0; Bacteria - 111; Metazoa - 12; Fungi - 192; Plants - 384; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 611 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:10229289..10230595 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37818.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 329 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MITTLLRRSL LDASKQATSI NGILFHQLAP AKYFRVPAVG GLRDFSKMTF EKKKTSEEEE GSGDGVKVND QGNKGEQLIV SYWGVKPMKI TKEDGTEWKW 101: SCFRPWETYK ADLTIDLKKH HVPSTLPDKI AYWMVKSLRW PTDLFFQRRY GCRAIMLETV AAVPGMVGGM LMHFKSLRRF EQSGGWIKAL LEEAENERMH 201: LMTFMEVAKP KWYERALVIS VQGVFFNAYL IGYIISPKFA HRMVGYLEEE AIHSYTEFLK ELDNGNIENV PAPAIAVDYW RLEADATLRD VVMVVRADEA 301: HHRDVNHYAS DIHYQGHELK EAPAPIGYH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)