AT3G27440.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.976 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : uridine kinase-like 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
One of the homologous genes predicted to encode proteins with UPRT domains (Uracil phosphoribosyltransferase). Five of these genes (At5g40870, At3g27190, At1g55810, At4g26510 and At3g27440) show a high level of identity, and are annotated as also containing a N-terminal uracil kinase (UK) domain. These genes are referred to as UKL1 (UK-like 1), UKL2, UKL3, UKL4 and UKL5, respectively. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
uridine kinase-like 5 (UKL5); FUNCTIONS IN: uracil phosphoribosyltransferase activity, kinase activity, phosphotransferase activity, alcohol group as acceptor, ATP binding; INVOLVED IN: biosynthetic process, metabolic process; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 6 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phosphoribulokinase/uridine kinase (InterPro:IPR006083), Uridine kinase (InterPro:IPR000764); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: uridine kinase-like 4 (TAIR:AT4G26510.2); Has 13214 Blast hits to 13202 proteins in 2627 species: Archae - 217; Bacteria - 10041; Metazoa - 552; Fungi - 516; Plants - 596; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1290 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:10155555..10157931 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52128.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 465 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKLSNGVRD HCLISDYVSP SAPAPLKQPF VIGVAGGTAS GKTTVCNMIM SQLHDQRVVL VNQDSFYHSL TKEKLNKVHE YNFDHPDAFN TEVLLSCMEK 101: LRSGQPVNIP SYDFKIHQSI ESSSPVNPGD VIILEGILVL NDPRVRDLMN MKIFVDTDAD VRLSRRIQRD TVERGRNIQN VLEQYTKFVK PSFDEYIQPS 201: MKYADIIIPR GGDNDVAIDL IVQHIRTKLC QHNLCKIYSN IFIISSTFQI KGMHTLIRDI NTTKHDFVFY ADRLIRLVVE HGLGHLPFTE KQITTPTGSV 301: YTGVDFCKRL CGVSVIRSGE SMENALRACC NGIKIGKILI HRENNDGRQL IYEKLPKDIS SRHVFLLDPV LASGYSAVKA ITLLLSKGVP ESHIIFLNLI 401: AAPQGIHALC KKFPMLKIVT SEIDSSLNED SRVIPGLGEF ADRYFGTNNI NSKVSSLSTN LKLRS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)