AT3G27280.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.994 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : prohibitin 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Part of protein complexes that are necessary for proficient mitochondrial function or biogenesis, thereby supporting cell division and differentiation in apical tissues | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
prohibitin 4 (PHB4); INVOLVED IN: response to stress; LOCATED IN: mitochondrion, plasma membrane, vacuole, respiratory chain complex I, plant-type cell wall; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Prohibitin (InterPro:IPR000163), Band 7 protein (InterPro:IPR001107); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: prohibitin 3 (TAIR:AT5G40770.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:10076904..10078051 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30639.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 279 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSQQVAISF LTNLAKAAFG LGVAATALNS SLYTVDGGER AVLFDRFRGV LDQTVGEGTH FLIPYLQTPH IYDIRTKPHT FSSKSGTKDL QMVNLTLRVL 101: FRPEVSRLPY IFQTLGLEYD EKVLPSIGNE VLKAVVANFN ADQLLTERPQ VSALVRDALI KRAREFNIEL DDIAITHLSY GAEFSRAVEA KQVAQQEAER 201: SKFVVMKADQ ERRAAVIRAE GESEAAQLIS DATAKAGMGL IELRRIEASR EVAATLARSP NVAYLPGGQS MLFNLNPGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)