AT3G27080.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : translocase of outer membrane 20 kDa subunit 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Component of the TOM complex involved in transport of nuclear-encoded mitochondrial proteins | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
translocase of outer membrane 20 kDa subunit 3 (TOM20-3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plant specific mitochondrial import receptor subunit TOM20 (InterPro:IPR010547); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: translocase outer membrane 20-1 (TAIR:AT3G27070.1); Has 97 Blast hits to 97 proteins in 23 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 95; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9985212..9986560 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 22566.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 202 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDTETEFDRI LLFEQIRQDA ENTYKSNPLD ADNLTRWGGV LLELSQFHSI SDAKQMIQEA ITKFEEALLI DPKKDEAVWC IGNAYTSFAF LTPDETEAKH 101: NFDLATQFFQ QAVDEQPDNT HYLKSLEMTA KAPQLHAEAY KQGLGSQPMG RVEAPAPPSS KAVKNKKSSD AKYDAMGWVI LAIGVVAWIS FAKANVPVSP 201: PR |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)