AT3G27070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : translocase outer membrane 20-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Form of TOM20, which is a component of the TOM complex, involved in transport of nuclear-encoded mitochondrial proteins | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
translocase outer membrane 20-1 (TOM20-1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Plant specific mitochondrial import receptor subunit TOM20 (InterPro:IPR010547); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: translocase of outer membrane 20 kDa subunit 3 (TAIR:AT3G27080.1); Has 97 Blast hits to 97 proteins in 22 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 95; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9983167..9984685 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21305.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 188 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDKLNFFEEI RKDAEETYKL NPEDADNLMR WGEALLELSQ FQNVIDSLKM IQDAISKLED AILIDPMKHD AVWCLGNAYT SYARLTPDDT QARLNFGLAY 101: LFFGIAVAQQ PDNQVYHKSL EMADKAPQLH TGFHKNRLLS LLGGVETLAI PSPKVVKNKK SSDEKYIVMG WVILAIGVVA CISFRKLR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)