AT3G26940.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.767 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Receptor-like cytoplasmic kinase, RLCKVII subfamily. Overexpression causes abnormal differential and elongation growth after organ differentiation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
CONSTITUTIVE DIFFERENTIAL GROWTH 1 (CDG1); FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: growth; EXPRESSED IN: flower; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT5G13160.1); Has 115206 Blast hits to 113810 proteins in 4116 species: Archae - 109; Bacteria - 12984; Metazoa - 42968; Fungi - 9463; Plants - 32819; Viruses - 350; Other Eukaryotes - 16513 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:9936707..9938936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 48510.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.34 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 432 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSCLCFRPS RKTKLKDKSH KRSIRNQTSS SSAQPAGTAK EVDSSSSQTV VQDSSRYRCQ IFSYRELAIA TNSFRNESLI GRGGFGTVYK GRLSTGQNIA 101: VKMLDQSGIQ GDKEFLVEVL MLSLLHHRNL VHLFGYCAEG DQRLVVYEYM PLGSVEDHLY DLSEGQEALD WKTRMKIALG AAKGLAFLHN EAQPPVIYRD 201: LKTSNILLDH DYKPKLSDFG LAKFGPSDDM SHVSTRVMGT HGYCAPEYAN TGKLTLKSDI YSFGVVLLEL ISGRKALMPS SECVGNQSRY LVHWARPLFL 301: NGRIRQIVDP RLARKGGFSN ILLYRGIEVA FLCLAEEANA RPSISQVVEC LKYIIDHTIR KERRTRRRLL GGNKDGAGTS RSPDETMMRM LEEEEEYVTS 401: EEAIERRRVI VDDARTWAGM NRRGATPPTP TP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)