AT3G25960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Pyruvate kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Pyruvate kinase family protein; FUNCTIONS IN: pyruvate kinase activity, magnesium ion binding, potassium ion binding, catalytic activity; INVOLVED IN: glycolysis; EXPRESSED IN: stem, leaf, seed; EXPRESSED DURING: E expanded cotyledon stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyruvate kinase, C-terminal-like (InterPro:IPR015795), Pyruvate kinase, active site (InterPro:IPR018209), Pyruvate kinase, beta-barrel-like (InterPro:IPR011037), Pyruvate kinase, alpha/beta (InterPro:IPR015794), Pyruvate/Phosphoenolpyruvate kinase, catalytic core (InterPro:IPR015813), Pyruvate kinase (InterPro:IPR001697), Pyruvate kinase, barrel (InterPro:IPR015793); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Pyruvate kinase family protein (TAIR:AT3G55650.1); Has 10279 Blast hits to 10169 proteins in 2719 species: Archae - 168; Bacteria - 6088; Metazoa - 548; Fungi - 221; Plants - 541; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2713 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:9498439..9499932 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53778.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 497 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEMLLGGQAT NGALRSKTKI VCTLGPASRS VEMIEKLLKA GMNVARFNFS HGSHSYHQET LDNLRTAMDN TGILCAVMLD TKSPVIRTGF LKEGKPIQLK 101: QGQEITISID YKIQGDSNTI SMSYKKLAED LKPGDVILCS DGTISLNVLS CDKYLGLVRC RCENSALLGE RKNVNLPGIV VDLPTLTEKD KEDIMQWGVP 201: NKIDIIALSF VRKGSDLIQV RKLLGEHSKS IMLMSKVENQ EGVMNFDKIL ENSDAFMVAR GDLGMEIPIE KMFLAQKTMI NKANAHGKPV VTATQMLESM 301: TVSPRPTRAE ATDVANAVLD GTDCVMLSGE TAAGAHPETA VLTMSRICKE AEDFIDYDIL HKKTLGMVSL PLSPIESLAA SAVSTARSVF ASAIVVLTRG 401: GYTAELVAKY RPSVPILSVI MPEIAECSDS VAHVARRGLI YRGIIPVVGC SARDSTEEMI RLAIGFAKTK GICKTGDSIV ALHKIDGSSI VRIVSVE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)