AT3G25490.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.990 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: wall associated kinase 5 (TAIR:AT1G21230.1); Has 117108 Blast hits to 115788 proteins in 4370 species: Archae - 143; Bacteria - 13531; Metazoa - 43249; Fungi - 9742; Plants - 32887; Viruses - 438; Other Eukaryotes - 17118 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:9241725..9243113 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49076.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 433 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKLQHVVYLV AIFFVVAIFV IACIEENKYL VWIMIILANT TNILSLVRSI SYIKNIRKHQ KDTKIQRQLF FEKNGGGMLI ERLSGAGSSN IDFKIFTEED 101: MKEATNGYDV SRILGQGGQW TVYKGILPDN SIVAIKKTRL GDNNQVEQFI NEVLVLSQIN HRNVVKLLGC CLETEVPLLV YEFITGGSLF DHLHGSMFVS 201: SLTWEHRLEI AIEVAGAIAY LHSGASIPII HRDIKTENIL LDENLTAKVA DFGASKLKPM DKEQLTTMVQ GTLGYLDPEY YTTWLLNEKS DVYSFGVVLM 301: ELISGQKALC FERPETSKHL VSYFVLATKE NRLHEIIDDQ VLNEENQREI HEAARVAVEC TRLKGEERPR MIEVAAELET LRAKTTKHNW LDQYPEENVH 401: LLGSNIVSAQ GHTSSRGYDN NKNVARFDIE AGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)