AT3G24540.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.508 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: proline extensin-like receptor kinase 1 (TAIR:AT3G24550.1); Has 142300 Blast hits to 130214 proteins in 4942 species: Archae - 153; Bacteria - 16829; Metazoa - 51492; Fungi - 12265; Plants - 39612; Viruses - 1316; Other Eukaryotes - 20633 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:8952903..8955621 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 55701.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 509 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARSNRCVPQ NSSIVQIPIE EVFKTQLKSR WQQITMSSAS SPPPPQVFVP EPLFSEPPPP PKAPVNVSLS PPPPPRSPST STPPRLGNRN PPPPASPSGQ 101: EPTTPTMTPG FSLSPPSPSR LSTGAVVGIS IGGGVFVLTL IFFLCKKKRP RDDKALPAPI GIHQSTFTYG ELARATNKFS EANLLGEGGF GFVYKGILNN 201: GNEVAVKQLK VGSAQGEKEF QAEVNIISQI HHRNLVSLVG YCIAGAQRLL VYEFVPNNTL EFHLHGKGRP TMEWSLRLKI AVSSSKGLSY LHENCNPKII 301: HRDIKAANIL IDFKFEAKVA DFGLAKIALD TNTHVSTRVM GTFGYLAPEY AASGKLTEKS DVYSFGVVLL ELITGRRPVD ANNVYADDSL VDWARPLLVQ 401: ALEESNFEGL ADIKLNNEYD REEMARMVAC AAACVRYTAR RRPRMDQVVR VLEGNISPSD LNQGITPGHS NTVSVRLDAR AVRVKPHGEM DSRWGRFKRT 501: AQRYGGDSL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)