AT3G24350.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.504 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : syntaxin of plants 32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Glycoside Hydrolase Family 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
syntaxin of plants 32 (SYP32); FUNCTIONS IN: SNAP receptor activity; INVOLVED IN: intracellular protein transport, cellular membrane fusion; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Target SNARE coiled-coil domain (InterPro:IPR000727), Syntaxin/epimorphin, conserved site (InterPro:IPR006012), t-SNARE (InterPro:IPR010989), Syntaxin, N-terminal (InterPro:IPR006011); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: syntaxin of plants 31 (TAIR:AT5G05760.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:8837733..8839402 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 40839.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 361 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSARHGQSSY RDRSDEFFKI VETLRRSIAP APAANNVPYG NNRNDGARRE DLINKSEFNK RASHIGLAIN QTSQKLSKLA KRIRMVLRSR TDLFSVAKRT 101: SVFDDPTQEI QELTVVIKQE ISALNSALVD LQLFRSSQND EGNNSRDRDK STHSATVVDD LKYRLMDTTK EFKDVLTMRT ENMKVHESRR QLFSSNASKE 201: STNPFVRQRP LAAKAAASES VPLPWANGSS SSSSQLVPWK PGEGESSPLL QQSQQQQQQQ QQQMVPLQDT YMQGRAEALH TVESTIHELS SIFTQLATMV 301: SQQGEIAIRI DQNMEDTLAN VEGAQSQLAR YLNSISSNRW LMMKIFFVLI AFLMIFLFFV A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)