AT3G23940.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.998 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : dehydratase family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
dehydratase family; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dihydroxy-acid dehydratase (InterPro:IPR004404), Dihydroxy-acid/6-phosphogluconate dehydratase, conserved site (InterPro:IPR020558), Dihydroxy-acid/6-phosphogluconate dehydratase (InterPro:IPR000581). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:8648780..8652323 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64717.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 606 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQATIFSPRA TLFPCKPLLP SHNVNSRRPS IISCSAQSVT ADPSPPITDT NKLNKYSSRI TEPKSQGGSQ AILHGVGLSD DDLLKPQIGI SSVWYEGNTC 101: NMHLLKLSEA VKEGVENAGM VGFRFNTIGV SDAISMGTRG MCFSLQSRDL IADSIETVMS AQWYDGNISI PGCDKNMPGT IMAMGRLNRP GIMVYGGTIK 201: PGHFQDKTYD IVSAFQSYGE FVSGSISDEQ RKTVLHHSCP GAGACGGMYT ANTMASAIEA MGMSLPYSSS IPAEDPLKLD ECRLAGKYLL ELLKMDLKPR 301: DIITPKSLRN AMVSVMALGG STNAVLHLIA IARSVGLELT LDDFQKVSDA VPFLADLKPS GKYVMEDIHK IGGTPAVLRY LLELGLMDGD CMTGQTLAQN 401: LENVPSLTEG QEIIRPLSNP IKETGHIQIL RGDLAPDGSV AKITGKEGLY FSGPALVFEG EESMLAAISA DPMSFKGTVV VIRGEGPKGG PGMPEMLTPT 501: SAIMGAGLGK ECALLTDGRF SGGSHGFVVG HICPEAQEGG PIGLIKNGDI ITIDIGKKRI DTQVSPEEMN DRRKKWTAPA YKVNRGVLYK YIKNVQSASD 601: GCVTDE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)