AT3G23630.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : isopentenyltransferase 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an isopentenyl transferase involved in cytokinin biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
isopentenyltransferase 7 (IPT7); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: tRNA isopentenyltransferase (InterPro:IPR002627); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: isopentenyltransferase 5 (TAIR:AT5G19040.1); Has 8574 Blast hits to 7864 proteins in 2586 species: Archae - 0; Bacteria - 5836; Metazoa - 176; Fungi - 188; Plants - 290; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2084 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:8488878..8489867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36981.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 329 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKFSISSLKQ VQPILCFKNK LSKVNVNSFL HPKEKVIFVM GATGSGKSRL AIDLATRFQG EIINSDKIQL YKGLDVLTNK VTPKECRGVP HHLLGVFDSE 101: AGNLTATQYS RLASQAISKL SANNKLPIVA GGSNSYIEAL VNHSSGFLLN NYDCCFIWVD VSLPVLNSFV SKRVDRMMEA GLLEEVREVF NPKANYSVGI 201: RRAIGVPELH EYLRNESLVD RATKSKMLDV AVKNIKKNTE ILACRQLKKI QRLHKKWKMS MHRVDATEVF LKRNVEEQDE AWENLVARPS ERIVDKFYNN 301: NNQLKNDDVE HCLAASYGGG SGSRAHNMI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)