AT3G22250.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
UDP-Glycosyltransferase superfamily protein; FUNCTIONS IN: UDP-glycosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: metabolic process; EXPRESSED IN: pedicel; EXPRESSED DURING: 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT1G22400.1); Has 6488 Blast hits to 6427 proteins in 402 species: Archae - 0; Bacteria - 208; Metazoa - 1301; Fungi - 24; Plants - 4818; Viruses - 90; Other Eukaryotes - 47 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:7867806..7870053 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52148.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 461 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKVTQKPKII FIPYPAQGHV TPMLHLASAF LSRGFSPVVM TPESIHRRIS ATNEDLGITF LALSDGQDRP DAPPSDFFSI ENSMENIMPP QLERLLLEED 101: LDVACVVVDL LASWAIGVAD RCGVPVAGFW PVMFAAYRLI QAIPELVRTG LVSQKGCPRQ LEKTIVQPEQ PLLSAEDLPW LIGTPKAQKK RFKFWQRTLE 201: RTKSLRWILT SSFKDEYEDV DNHKASYKKS NDLNKENNGQ NPQILHLGPL HNQEATNNIT ITKTSFWEED MSCLGWLQEQ NPNSVIYISF GSWVSPIGES 301: NIQTLALALE ASGRPFLWAL NRVWQEGLPP GFVHRVTITK NQGRIVSWAP QLEVLRNDSV GCYVTHCGWN STMEAVASSR RLLCYPVAGD QFVNCKYIVD 401: VWKIGVRLSG FGEKEVEDGL RKVMEDQDMG ERLRKLRDRA MGNEARLSSE MNFTFLKNEL N |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)