AT3G21730.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 0.735 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : Dihydroneopterin aldolase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
FOLB3; FUNCTIONS IN: dihydroneopterin aldolase activity; INVOLVED IN: folic acid and derivative metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Dihydroneopterin aldolase (InterPro:IPR006157), Dihydroneopterin aldolase subgroup (InterPro:IPR006156); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Dihydroneopterin aldolase (TAIR:AT3G11750.1); Has 2927 Blast hits to 2927 proteins in 1231 species: Archae - 4; Bacteria - 2376; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 86; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 461 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr3:-:7659761..7661179 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 18036.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 160 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MHSSLKTMAP AKLERLCVLS FFLFCATVFG TESLESLPED KLILRGLKFY GFHGVLPEER ELGGLFIVDI NLWLSLKKAI ESDNLADTVS FADTFRLVKK 101: IVEGPPRNLY ETVADDIASE MLETFPKINV IRVKFGKPNP SLVNSTVDFL GAELFRKRNH |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)