AT3G21260.3
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.941 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Glycolipid transfer protein (GLTP) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Glycolipid transfer protein (GLTP) family protein; FUNCTIONS IN: glycolipid transporter activity, glycolipid binding; INVOLVED IN: glycolipid transport; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycolipid transfer protein, GLTP (InterPro:IPR014830); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glycolipid transfer protein 2 (TAIR:AT1G21360.1); Has 501 Blast hits to 501 proteins in 155 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 232; Fungi - 110; Plants - 118; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 41 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:7464132..7465785 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26518.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 233 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKRKRCEMEE TTKKKKMTEI GSAIEELSVL SIAKTTIVTT EKEAINIINL PLKPLLSFCN IIVQVLDKIG PTMAVLRHDI DQNIQRLEKM WESDPLVYSN 101: LVEILRKEAK EGSSRKPKSC SRAALWLTRA MDFTLALLQR LVKDMSQNME QAIEECYNLT IKPWHGWISS AAFKVALKLV PNNNTFINVL AAKDETHQMV 201: QDDITSLISL LIPLLSQLHS ILELYEVSKL KSP |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)