AT3G20970.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : NFU domain protein 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein containing the NFU domain that may be involved in iron-sulfur cluster assembly. Part of a five member gene family, more closely related to NFU5 than to NFU1,2, and 3. Targeted to the mitochondrion. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
NFU domain protein 4 (NFU4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: NIF system FeS cluster assembly, NifU, C-terminal (InterPro:IPR001075), HIRA-interacting protein 5 (InterPro:IPR017065), NIF system FeS cluster assembly, NifU-like scaffold, N-terminal (InterPro:IPR014824); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NFU domain protein 5 (TAIR:AT1G51390.1); Has 6036 Blast hits to 5990 proteins in 1590 species: Archae - 18; Bacteria - 3114; Metazoa - 168; Fungi - 162; Plants - 179; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2392 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:7348277..7350069 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 30506.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.12 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 283 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKGIARLVTS LSRIGGRKVV SGTSTVTSSS SSSLLLSRRS LFISATNLLN SRTKDSALPS LNSSLLAQKW NFLGGQRRTM FIQTQSTPNP SSLMFYPGKP 101: VMEVGSADFP NVRSALGSPL AKSIYSIDGV VRVFFGSDFV TVTKSDDVSW DILKPEIFAA VMDFYSSGQP LFLDSQAAAA KDTAISEDDS ETVAMIKELL 201: ETRIRPAVQD DGGDIEYCGF DPESGIVKLR MQGACSGCPS SSVTLKSGIE NMLMHYVSEV KGVEQEFDGE DEEGTLSGEM RVE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)