AT3G19980.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : flower-specific, phytochrome-associated protein phosphatase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes catalytic subunit of serine/threonine protein phosphatase 2A. It can associate with phytochromes A and B in vitro. Mutant plants display an accelerated flowering phenotype. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
flower-specific, phytochrome-associated protein phosphatase 3 (FYPP3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Metallophosphoesterase (InterPro:IPR004843), Serine/threonine-specific protein phosphatase/bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase (InterPro:IPR006186); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Calcineurin-like metallo-phosphoesterase superfamily protein (TAIR:AT1G50370.1); Has 6822 Blast hits to 6670 proteins in 515 species: Archae - 81; Bacteria - 277; Metazoa - 2341; Fungi - 1410; Plants - 975; Viruses - 8; Other Eukaryotes - 1730 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:6962008..6964761 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34847.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 303 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDLDQWISKV KDGQHLSEDE LQLLCEYVKE ILIEESNVQP VNSPVTVCGD IHGQFHDLMK LFQTGGHVPD TNYIFMGDFV DRGYNSLEVF TILLLLKARY 101: PANITLLRGN HESRQLTQVY GFYDECQRKY GNANAWRYCT DVFDYLTLSA IIDGTVLCVH GGLSPDVRTI DQIRLIERNC EIPHEGPFCD LMWSDPEDIE 201: TWAVSPRGAG WLFGSRVTTE FNHINKLDLV CRAHQLVQEG LKYMFQDKGL VTVWSAPNYC YRCGNVASIL SFNDNMEREV KFFTETEENN QMRGPRTGVP 301: YFL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)