AT3G17220.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.954 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pectin methylesterase inhibitor 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Pectin methylesterase inhibitor AtPMEI2. Inactivates AtPPME1 in vitro. Localized to Brefeldin A-induced compartments, and was found in FYVE-induced endosomal aggregates. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
pectin methylesterase inhibitor 2 (PMEI2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pectinesterase inhibitor (InterPro:IPR006501); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: pectin methylesterase inhibitor 1 (TAIR:AT1G48020.1); Has 238 Blast hits to 232 proteins in 20 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 238; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:5883328..5883849 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18368.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 173 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAYLTNRVL MSSLMFFVMT GSLNAQVADI KAICGKAKNQ SFCTSYMKSN PKTSGADLQT LANITFGSAQ TSASEGFRKI QSLVKTATNP TMKKAYTSCV 101: QHYKSAISSL NDAKQSLASG DGKGLNIKVS AAMEGPSTCE QDMADFKVDP SAVKNSGDFQ NICGIVLVIS NMM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)