AT3G17070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 0.814 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Peroxidase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Peroxidase family protein; FUNCTIONS IN: peroxidase activity, heme binding; INVOLVED IN: response to oxidative stress, oxidation reduction; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: guard cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Plant peroxidase (InterPro:IPR000823), Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial (InterPro:IPR002016); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Peroxidase superfamily protein (TAIR:AT5G40150.1); Has 4731 Blast hits to 4708 proteins in 320 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 13; Fungi - 403; Plants - 4233; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 78 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:5821048..5823165 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36808.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.07 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 339 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKPKSKVAES TAASCFLVMS LLCSCIIGDQ METNNEGLSY SYYEKTCPKV EEIVRSSLSS MFILDPTSPA ALLRLMFHDC QVQGCDASIL LEPIRDQQFT 101: ELDSAKNFGI RKRDLVGSIK TSLELECPKQ VSCSDVIILA ARDAVALTGG PLISVPLGRK DSLSTPSKHV ADSELPPSTA DVDTTLSLFA NKGMTIEESV 201: AIMGAHTIGV THCNNVLSRF DNANATSENM DPRFQTFLRV ACPEFSPTSQ AAEATFVPND QTSVIFDTAY YDDAIAGRGN LRIDSEIGAD PRTRPFVEAF 301: AADQDRFFNA FSSAFVKLSS YKVLTGNEGV IRSVCDKVD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)