AT3G16990.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Haem oxygenase-like, multi-helical | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Haem oxygenase-like, multi-helical; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem oxygenase-like, multi-helical (InterPro:IPR016084), TENA/THI-4 protein/Coenzyme PQQ biosynthesis protein C (InterPro:IPR004305); Has 259 Blast hits to 259 proteins in 88 species: Archae - 23; Bacteria - 94; Metazoa - 0; Fungi - 34; Plants - 38; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 70 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:5795937..5796783 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25071.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 221 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKRGVIDTW IDKHRSIYTA ATRHAFVVSI RDGSVDLSSF RTWLGQDYLF VRRFVPFVAS VLIRACKDSG ESSDMEVVLG GIASLNDEIE WFKREGSKWD 101: VDFSTVVPQR ANQEYGRFLE DLMSSEVKYP VIMTAFWAIE AVYQESFAHC LEDGNKTPVE LTGACHRWGN DGFKQYCSSV KNIAERCLEN ASGEVLGEAE 201: DVLVRVLELE VAFWEMSRGG Q |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)