AT3G15000.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cobalt ion binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
cobalt ion binding; FUNCTIONS IN: cobalt ion binding; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: plastid developmental protein DAG, putative (TAIR:AT3G06790.2); Has 57621 Blast hits to 29750 proteins in 1231 species: Archae - 14; Bacteria - 7130; Metazoa - 26978; Fungi - 8402; Plants - 8184; Viruses - 944; Other Eukaryotes - 5969 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:5050321..5052121 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42872.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 395 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATHTISRSI LCRPAKSLSF LFTRSFASSA PLAKSPASSL LSRSRPLVAA FSSVFRGGLV SVKGLSTQAT SSSLNDPNPN WSNRPPKETI LLDGCDFEHW 101: LVVVEPPQGE PTRDEIIDSY IKTLAQIVGS EDEARMKIYS VSTRCYYAFG ALVSEDLSHK LKELSNVRWV LPDSYLDVRN KDYGGEPFID GKAVPYDPKY 201: HEEWIRNNAR ANERNRRNDR PRNNDRSRNF ERRRENMAGG PPPQRPPMGG PPPPPHIGGS APPPPHMGGS APPPPHMGQN YGPPPPNNMG GPRHPPPYGA 301: PPQNNMGGPR PPQNYGGTPP PNYGGAPPAN NMGGAPPPNY GGGPPPQYGA VPPPQYGGAP PQNNNYQQQG SGMQQPQYQN NYPPNRDGSG NPYQG |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)