AT3G14225.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GDSL-motif lipase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Contains lipase signature motif and GDSL domain. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GDSL-motif lipase 4 (GLIP4); FUNCTIONS IN: lipase activity, carboxylesterase activity; INVOLVED IN: lipid metabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lipase, GDSL, active site (InterPro:IPR008265), Lipase, GDSL (InterPro:IPR001087), Esterase, SGNH hydrolase-type (InterPro:IPR013830); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GDSL-motif lipase 3 (TAIR:AT1G53990.1); Has 3248 Blast hits to 3210 proteins in 137 species: Archae - 0; Bacteria - 163; Metazoa - 0; Fungi - 27; Plants - 3047; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 11 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:4734616..4735993 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42031.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 377 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASPRFNSII IILFICTISL SIVSISCKED LKTNQAALFA FGDSLFEAGN NNYFDSISSF RSNFWPYGKT TFKFPTGRVS DGRIMIDFIA EYAWLPLIPP 101: NLQPGYSNSQ LTYGLNFATT AAGVFAGTFP GSVTNLSKDL GTQLNNFKNV EKTLRSNLGD AEARRVISKA VYLFHIGAND YQYPFFANTS TFSNTTKERF 201: IDFVIGNTTT VIEELYKLGA RKFGFLSLGP FGCTPSALII NSTKIGSCFE PVTELINLHN QEFPKVLRRL ERRLSGFKYA LHDFHTSLSQ RINNPSRYGF 301: KEGEMACCGS GPLRGINTCG FRNGPSQGYK LCENADDYVF FDPSHLTETA HQQIAELIWS GPPNVTAPYN LKTLFRL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)