AT3G12915.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein; FUNCTIONS IN: GTP binding, GTPase activity; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein synthesis factor, GTP-binding (InterPro:IPR000795), Translation elongation factor EFG/EF2, domain IV (InterPro:IPR005517), Translation elongation factor EFG/EF2, C-terminal (InterPro:IPR000640), Translation elongation factor EFTu/EF1A, domain 2 (InterPro:IPR004161), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), Elongation factor G/III/V (InterPro:IPR009022), Translation elongation/initiation factor/Ribosomal, beta-barrel (InterPro:IPR009000); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein (TAIR:AT1G56070.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:4112999..4115708 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 85209.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 767 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVIAHVDHG KSTLTDSLVA AAGIIAQETA GDVRMTDTRA DEAERGITIK STGISLYYEM TDASLKSFTG ARDGNEYLIN LIDSPGHVDF SSEVTAALRI 101: TDGALVVVDC IEGVCVQTET VLRQSLGERI RPVLTVNKMD RCFLELKVDG EEAYQNFQRV IENANVIMAT HEDPLLGDVQ VYPEKGTVAF SAGLHGWAFT 201: LTNFAKMYAS KFGVSESKMM ERLWGENFFD SATRKWTTKN WLPDLQAWKD KLWPMLEKLG IQMKPDEKEL MGKPLMKRVM QAWLPASTAL LEMMIFHLPS 301: PYTAQRYRVE NLYEGPLDDK YAAAIRNCDP DGPLMLYVSK MIPASDKGRF FAFGRVFSGT VSTGMKVRIM GPNYVPGEKK DLYVKSVQRT VIWMGKKQET 401: VEDVPCGNTV AMVGLDQFIT KNASDLPKLV EGLKRLAKSD PMVLCTMEES GEHIVAGAGE LHIEICVKDL QDFMGGADII VSDPVVSLRE TVFERSCRTV 501: MSKSPNKHNR LYMEARPMED GLAEAIDEGR IGPSDDPKIR SKILAEEFGW DKDLAKKIWA FGPDTTGPNM VVDMCKGVQY LNEIKDSVVA GFQWASKEGP 601: LAEENMRGVC YEVCDVVLHA DAIHRGCGQM ISTARRAIYA SQLTAKPRLL EPVYMVEIQA PEGALGGIYS VLNQKRGHVF EEMQRPGTPL YNIKAYLPVV 701: ESFGFSGQLR AATSGQAFPQ CVFDHWDMMS SDPLETGSQA ATLVADIRKR KGLKLQMTPL SDYEDKL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)