AT3G12290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Amino acid dehydrogenase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Amino acid dehydrogenase family protein; FUNCTIONS IN: binding, catalytic activity; INVOLVED IN: folic acid and derivative biosynthetic process, metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR020631), Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase (InterPro:IPR000672), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, conserved site (InterPro:IPR020867), Tetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, catalytic domain (InterPro:IPR020630); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Amino acid dehydrogenase family protein (TAIR:AT4G00620.1); Has 9969 Blast hits to 9964 proteins in 2781 species: Archae - 105; Bacteria - 5648; Metazoa - 394; Fungi - 308; Plants - 157; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3357 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:3919591..3921326 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31591.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 299 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASSSDHTAK IIDGKAIAHT IRSEIAEEVR GLSEKHGKVP GLAVVIVGSR KDSQTYVNTK RKACAEVGIK SFDVGLPEEV SEADLISKVH ELNSNPDVHG 101: ILVQLPLPKH INEEHILGAI SIDKDVDGFH PLNIGKLAMK GREPLFLPCT PKGCLELLAR SGVKIKGQRA VVVGRSNIVG LPVSLLLLKA DATVTTVHSH 201: TKDPEAIIRE ADIVIAACGQ AHMIKGNWIK PGAAVIDVGT NAVSDPSKKS GYRLVGDVDF AEASKVAGFI TPVPGGVGPM TVAMLLRNTV DGAKRVFGE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)