AT3G12240.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : serine carboxypeptidase-like 15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
serine carboxypeptidase-like 15 (SCPL15); FUNCTIONS IN: serine-type carboxypeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine carboxypeptidase-like 14 (TAIR:AT3G12230.1); Has 3798 Blast hits to 3708 proteins in 428 species: Archae - 0; Bacteria - 341; Metazoa - 625; Fungi - 840; Plants - 1569; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 423 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3902436..3904918 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49352.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 436 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASWIFKLLL LLQCVLVLIQ HADSSSIIRY LPGFEGPLPF ELETGYIGVG QKEEDQLFYY FIKSENNPEE DPLLVWLTGG PGCSSFSGLV YENGPLAFKV 101: ETYNGSVPTL VSTTYSWTKV ANIIYLDQPV GTGFSYSRNP FADIPSDTGS VKRVNEFVRK WLAKHPEYFS NPFYVTGNSY SGKVIPAIVQ EISNGNYICC 201: KPQINLQGYV IGNPVAYYDH DKDFRIPFAH GVALISDELF ESLKASCGGS YSVVDPLNTE CLKLIEDYDK CVSGIYEELI LKSKCEHTSP DCYTYRYLLS 301: EYWADNETVR RALKVVKGSK GTWERCDYRV LSNQDIKSSI PFHINNSIRG YRSLVISGDH DMTIPFLGTQ AWIRSLNYSI TEKWRPWMIL DQVAGYTKTY 401: ANKMTLATVK GGGHTLEYKP EENSVLFKRW ISGQPL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)