AT3G12230.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:extracellular 0.996 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : serine carboxypeptidase-like 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
serine carboxypeptidase-like 14 (scpl14); FUNCTIONS IN: serine-type carboxypeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: endomembrane system; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase S10, serine carboxypeptidase (InterPro:IPR001563); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: serine carboxypeptidase-like 15 (TAIR:AT3G12240.1); Has 3660 Blast hits to 3566 proteins in 378 species: Archae - 0; Bacteria - 216; Metazoa - 635; Fungi - 834; Plants - 1566; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 409 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3899431..3901879 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 49022.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.92 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 435 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGSWIPKLLL LQLVLLLTKH ADSSSIIKYL PGFEGPLPFE LETGYIGVGD EDEDQMFYYF IKSESNPEED PLLVWLSGGP GCSSFTGLVY ENGPLGFKVE 101: AYNGSIPTLV STTYSWTKVA NIIYLDQPVG AGFSYSRNPF ADRPSDTGSA KLVNEFVRKW LAKHPDYFSN PFYVTGNSYS GKVIPAIVQE ISNGNYICCK 201: PQINLQGYVI GNPVAYYDHD KDSRIPFAHG VALISDELFE SLKRSCGGSY SIVDPLNTEC LKLIKDYHKC VSGIYQELIL KPKCETTSPD CYTYRYLLSI 301: YWANNEIVRR ALKVVEGSKG KWERCDLSVR SNQDIKSSIP YHMNNSIKGY RSLVISGDHD MTIPFLGTQA WIRSLNYSIT EKWRPWMILD QVAGYTKTYA 401: NKMTLATVKG GGHTLEYKPE ENSILFKRWI SGQPL |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)