AT3G12140.3
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.950 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Emsy N Terminus (ENT)/ plant Tudor-like domains-containing protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Emsy N Terminus (ENT)/ plant Tudor-like domains-containing protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ENT (InterPro:IPR005491), Tudor-like, plant (InterPro:IPR014002); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Emsy N Terminus (ENT)/ plant Tudor-like domains-containing protein (TAIR:AT5G06780.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:3869121..3870964 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 43321.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.59 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 383 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: METQIHQLEQ EAYTAVLRAF KAQSDAISWE KESLITELRK ELRVSDDEHR ELLSRVNKDD TIQRIRDWRQ GGASQITRHA TIQPFDVLPS PTFSAARKKQ 101: KTFPSYNPSI GATGNRSFNN RLVSSGISGN ESAEALIGRK VWTKWPEDNH FYEAIITQYN ADEGRHALVY DIHAANETWE WVDLKEIPPE DIRWDGEESG 201: VALNIGHGSA SFRGNRRGQI HGGRGRGPRI HQPRRELVPP PTQQNGSGGR RTSSDDIELF NTDSLVKEVE RVFDSTHPDP LELDKAKKML KEHEQALIAA 301: IARLADTSDG EMGNNNKSTL RLVCNLRIIY YLPLNFCVMM IISSIITNLI LGKIIRELIH TCSACDFSVT CKQLNSLKYR SSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)