AT3G11830.2
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.943 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : TCP-1/cpn60 chaperonin family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
TCP-1/cpn60 chaperonin family protein; FUNCTIONS IN: unfolded protein binding, ATP binding; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Chaperone, tailless complex polypeptide 1 (InterPro:IPR017998), Chaperonin Cpn60/TCP-1 (InterPro:IPR002423), T-complex protein 1, eta subunit (InterPro:IPR012720), Chaperonin TCP-1, conserved site (InterPro:IPR002194); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: T-complex protein 1 alpha subunit (TAIR:AT3G20050.1). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:3732734..3736156 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59519.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 555 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASMMQPQII LLKEGTDTSQ GKAQLVSNIN ACTAVGDVVR TTLGPRGMDK LIHDDKGSVT ISNDGATIMK LLDIVHPAAK ILVDIAKSQD SEVGDGTTTV 101: VLLAAEFLKE AKPFIEDGVH AQNLIRSYRT ASTLAIAKVK ELAVSIEGKS VEEKKGLLAK CAATTLSSKL IGGEKEFFAT MVVDAVMAIG NDDRLNLIGI 201: KKVPGGNMRD SFLVDGVAFK KTFSYAGFEQ QPKKFLNPKI LLLNIELELK SEKENAEIRL SDPSQYQSIV DAEWNIIYDK LDKCVESGAK VVLSRLAIGD 301: LATQYFADRD IFCAGRVAEE DLNRVAAAAG GTVQTSVNNI IDEVLGTCEI FEEKQVGGER FNIFSGCPSG RTATIVLRGG ADQFIEEAER SLHDAIMIVR 401: RAVKNSTVVP GGGAIDISKY LRQHSRTIAG KSQLFINSYA KALEVIPRQL CDNAGFDATD VLNKLRQKHA MQSGEGASYG VDINTGGIAD SFANFVWEPA 501: VVKINAINAA TEAACLILSV DETVKNPKSE SAQGDAAGAM GRGRGGGRGR GMRRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)