AT3G09680.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein S12/S23 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein S12/S23 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: cytosolic small ribosomal subunit, cytosolic ribosome, ribosome, nucleolus; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein S23, eukaryotic/archaeal (InterPro:IPR005680), Ribosomal protein S12/S23 (InterPro:IPR006032), Nucleic acid-binding, OB-fold (InterPro:IPR012340), Nucleic acid-binding, OB-fold-like (InterPro:IPR016027); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein S12/S23 family protein (TAIR:AT5G02960.1); Has 9046 Blast hits to 9043 proteins in 3116 species: Archae - 259; Bacteria - 5143; Metazoa - 487; Fungi - 298; Plants - 975; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1884 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:2969197..2970291 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 15770.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.55 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 142 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGKTRGMGAG RKLKQLRITQ RWADKHYKKS NRGNEWKKPF ACSSHAKGIV LEKIGIEAKQ PNSAIRKCAR VQLIKNGKKI AAFVPNDGCL NYIEENDEVL 101: IAGFGRKGHA VGDIPGVRFK VVKVSGVSLL ALFKEKKEKP RS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)