AT3G09640.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : ascorbate peroxidase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a cytosolic ascorbate peroxidase APX2. Ascorbate peroxidases are enzymes that scavenge hydrogen peroxide in plant cells. Eight types of APX have been described for Arabidopsis: three cytosolic (APX1, APX2, APX6), two chloroplastic types (stromal sAPX, thylakoid tAPX), and three microsomal (APX3, APX4, APX5) isoforms. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
ascorbate peroxidase 2 (APX2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Haem peroxidase (InterPro:IPR010255), Plant ascorbate peroxidase (InterPro:IPR002207), Peroxidases heam-ligand binding site (InterPro:IPR019793), Haem peroxidase, plant/fungal/bacterial (InterPro:IPR002016), Peroxidase, active site (InterPro:IPR019794); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ascorbate peroxidase 1 (TAIR:AT1G07890.8); Has 8439 Blast hits to 8256 proteins in 1276 species: Archae - 55; Bacteria - 2395; Metazoa - 20; Fungi - 832; Plants - 3373; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1764 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr3:+:2956301..2958163 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 28007.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 6.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.37 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 251 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVKKSYPEVK EEYKKAVQRC KRKLRGLIAE KHCAPIVLRL AWHSAGTFDV KTKTGGPFGT IRHPQELAHD ANNGLDIAVR LLDPIKELFP ILSYADFYQL 101: AGVVAVEITG GPEIPFHPGR LDKVEPPPEG RLPQATKGVD HLRDVFGRMG LNDKDIVALS GGHTLGRCHK ERSGFEGAWT PNPLIFDNSY FKEILSGEKE 201: GLLQLPTDKA LLDDPLFLPF VEKYAADEDA FFEDYTEAHL KLSELGFADK E |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)