AT3G09470.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Major facilitator superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Major facilitator superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); Has 797 Blast hits to 785 proteins in 150 species: Archae - 2; Bacteria - 12; Metazoa - 475; Fungi - 196; Plants - 54; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 58 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:2910668..2914410 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50295.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 464 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MESRNDEEAP LISASGEDRK VRAGKCYTRD VHILSISFLL IFLAYGAAQN LETTVNKDLG TISLGILYVS FMFCSMVASL VVRLMGSKNA LVLGTTGYWL 101: FVAANLKPSW FTMVPASLYL GFAASIIWVG QGTYLTSIAR SHATDHGLHE GSVIGVFNGE FWAMFACHQL FGNLITLALL KDGKEGSTSG TTLLMLVFLF 201: SMTLGTILMF FIRKIDGEDG KGPVGSPVGL VDSLASLPRM IITPLLDIRM LLIVPLLAYS GLQQAFVWAE FTKEIVTPAI GVSGVGGAMA VYGALDAVCS 301: MTAGRFTSGL SSITFIVSGG AVAQASVFLW LLLGYRQTSG VLGTAYPLIM AAILGIGDGI LNTQISALLA LLFKHDTEGA FAQLKVWQSA AIAIVFFLSP 401: YISLQAMLIV MLVMRDFTVE ETHFTSSLLF QNSLSRNSLR FRRCLTIKIW DSLPISWESS FSYW |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)