AT3G08560.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.967 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : vacuolar H+-ATPase subunit E isoform 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
vacuolar H+-ATPase subunit E isoform 2 (VHA-E2); FUNCTIONS IN: hydrogen-exporting ATPase activity, phosphorylative mechanism, proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism; INVOLVED IN: ATP synthesis coupled proton transport; LOCATED IN: vacuole, mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex; EXPRESSED IN: petal, leaf whorl, male gametophyte, flower, vegetative cell; EXPRESSED DURING: pollen developmental stages, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, V1/A1 complex, subunit E (InterPro:IPR002842); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: vacuolar ATP synthase subunit E1 (TAIR:AT4G11150.1); Has 759 Blast hits to 757 proteins in 292 species: Archae - 68; Bacteria - 19; Metazoa - 249; Fungi - 151; Plants - 127; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 145 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:2600130..2601907 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 26854.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.66 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 235 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNDADVSKQI QQMVRFIRQE AEEKANEISI SAEEEFNIER LQLLESAKRK LRQDYDRKLK QVDIRKRIDY STQLNASRIK YLQAQDDVVT AMKDSAAKDL 101: LRVSNDKNNY KKLLKSLIIE SLLRLKEPSV LLRCREMDKK VVESVIEDAK RQYAEKAKVG SPKITIDEKV FLPPPPNPKL PDSHDPHCSG GVVLASQDGK 201: IVCENTLDAR LDVAFRQKLP QIRTRLVGAP ETSRA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)