AT3G05790.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker)
Arabidopsis cell culture (plastidal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : lon protease 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the Lon protease-like proteins (Lon1/At5g26860, Lon2/At5g47040, Lon3/At3g05780, Lon4/At3g05790). Lon is a multifunctional ATP-dependent protease which exists in bacteria, archaea and within organelles in eukaryotic cells. Lon proteases are responsible for the degradation of abnormal, damaged and unstable proteins. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
lon protease 4 (LON4); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: proteolysis; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast; EXPRESSED IN: 8 plant structures; EXPRESSED DURING: 6 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ATPase, AAA-type, core (InterPro:IPR003959), Peptidase S16, active site (InterPro:IPR008268), Peptidase S16, ATP-dependent protease La (InterPro:IPR004815), Peptidase S16, lon N-terminal (InterPro:IPR003111), Peptidase S16, Lon C-terminal (InterPro:IPR008269), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), Ribosomal protein S5 domain 2-type fold (InterPro:IPR020568), Peptidase S16, Lon protease, C-terminal (InterPro:IPR001984); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: lon protease 1 (TAIR:AT5G26860.1); Has 17176 Blast hits to 15609 proteins in 2554 species: Archae - 375; Bacteria - 9875; Metazoa - 528; Fungi - 538; Plants - 282; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 5575 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:1720154..1725182 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 104931.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 942 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLKFLTPTAY ASHHVTPATR FRSTPVKNLL FKQLTLLTGW NRSSYELGRR SFSSDLDSDT KSSTTTVSAK PHLDDCLTVI ALPLPHKPLI PGFYMPIYVK 101: DPKVLAALQE SRRQQAPYAG AFLLKDDASS DSSSSSETEN ILEKLKGKEL INRIHEVGTL AQISSIQGEQ VILIGHRQLR ITEMVSESED PLTVKVDHLK 201: DKPYDKDDDV IKATYFQVMS TLRDVLKTTS LWRDHVRTYT QACSLHIWHC LRHIGEFNYP KLADFGAGIS GANKHQNQGV LEELDVHKRL ELTLELVKKE 301: VEINKIQESI AKAVEEKFSG DRRRIILKEQ INAIKKELGG ETDSKSALSE KFRGRIDPIK DKIPGHVLKV IEEELKKLQL LETSSSEFDV TCNYLDWLTV 401: LPWGNFSDEN FNVLRAEKIL DEDHYGLSDV KERILEFIAV GGLRGTSQGK IICLSGPTGV GKTSIGRSIA RALDRKFFRF SVGGLSDVAE IKGHRRTYIG 501: AMPGKMVQCL KNVGTENPLV LIDEIDKLGV RGHHGDPASA MLELLDPEQN ANFLDHYLDV PIDLSKVLFV CTANVTDTIP GPLLDRMEVI TLSGYITDEK 601: MHIARDYLEK TARRDCGIKP EQVDVSDAAF LSLIEHYCRE AGVRNLQKQI EKIFRKIALK LVRKAASTEV PRISDDVTTD TEETKSLAKT DLESPETSAE 701: GSTVLTDELA TGDPTESTTE QSGEVAETVE KYMIDESNLS DYVGKPVFQE EKIYEQTPVG VVMGLAWTSM GGSTLYIETT FVEEGEGKGG LHITGRLGDV 801: MKESAEIAHT VARRIMLEKE PENKLFANSK LHLHVPAGAT PKDGPSAGCT MITSLLSLAL KKPVRKDLAM TGEVTLTGRI LAIGGVKEKT IAARRSQVKV 901: IIFPEANRRD FDELARNVKE GLEVHFVDEY EQIFELAFGY DH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)