AT3G05720.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : importin alpha isoform 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Putative importin alpha isoform. When overexpressed can rescue the impa-4 decreased transformation susceptibility phenotype. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
importin alpha isoform 7 (IMPA-7); FUNCTIONS IN: protein transporter activity, binding; INVOLVED IN: intracellular protein transport, protein import into nucleus; LOCATED IN: nucleus, nuclear pore, cytoplasm; EXPRESSED IN: sperm cell, male gametophyte, flower, pollen tube; EXPRESSED DURING: M germinated pollen stage, 4 anthesis; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Importin-alpha-like, importin-beta-binding domain (InterPro:IPR002652), Armadillo-like helical (InterPro:IPR011989), Armadillo (InterPro:IPR000225), Armadillo-type fold (InterPro:IPR016024); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: importin alpha isoform 1 (TAIR:AT3G06720.2); Has 3085 Blast hits to 2425 proteins in 261 species: Archae - 0; Bacteria - 4; Metazoa - 1320; Fungi - 449; Plants - 724; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 588 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:1687992..1691736 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 58476.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 528 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKGGETMSVR RSGYKAVVDG VGGRRRREDD MVEIRKAKRE ESLLKKRREA LPHSPSADSL DQKLISCIWS DERDLLIEAT TQIRTLLCGE MFNVRVEEVI 101: QAGLVPRFVE FLTWDDSPQL QFEAAWALTN IASGTSENTE VVIDHGAVAI LVRLLNSPYD VVREQVVWAL GNISGDSPRC RDIVLGHAAL PSLLLQLNHG 201: AKLSMLVNAA WTLSNLCRGK PQPPFDQVSA ALPALAQLIR LDDKELLAYT CWALVYLSDG SNEKIQAVIE ANVCARLIGL SIHRSPSVIT PALRTIGNIV 301: TGNDSQTQHI IDLQALPCLV NLLRGSYNKT IRKEACWTVS NITAGCQSQI QAVFDADICP ALVNLLQNSE GDVKKEAAWA ICNAIAGGSY KQIMFLVKQE 401: CIKPLCDLLT CSDTQLVMVC LEALKKILKV GEVFSSRHAE GIYQCPQTNV NPHAQLIEEA EGLEKIEGLQ SHENNDIYET AVKILETYWM EEEEEEDQEQ 501: QDMIYFPVDN FANMPTSSGT LSEMHCGP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)