AT3G05310.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.873 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : MIRO-related GTP-ase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with similarity to MIRO GTPases. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
MIRO-related GTP-ase 3 (MIRO3); FUNCTIONS IN: GTP binding; INVOLVED IN: mitochondrion transport along microtubule, small GTPase mediated signal transduction; LOCATED IN: mitochondrial outer membrane, intracellular; EXPRESSED IN: central cell; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), EF hand associated, type-1 (InterPro:IPR013566), Mitochondrial Rho-like (InterPro:IPR013684), EF hand associated, type-2 (InterPro:IPR013567), Mitochondrial Rho GTPase (InterPro:IPR021181), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), MIRO (InterPro:IPR020860); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MIRO-related GTP-ase 1 (TAIR:AT5G27540.2); Has 1943 Blast hits to 1932 proteins in 256 species: Archae - 0; Bacteria - 18; Metazoa - 950; Fungi - 261; Plants - 517; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 197 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:1510160..1513301 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 73070.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 648 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWMGVGDSSG SPKPIRIVVV GEKGSGKSSL IMAAARNTFH PNIPSLLPYT NLPSEFFPDR IPATVIDTSS RPEDKGKVVK EVRQADAIVL TFAFDRPETL 101: DRLSKYWLPL FRQLEVRVPI IVAGYEVDNK EAYNHFSIEQ ITSALMKQYR EVETSIQWSA QRLDQAKDVL YYAQKAVIDP VGPVFDQENN VLKPRCIAAL 201: KRIFLLSDHN MDGILSDEEL NELQKKCFDT PLVPCEIKQM KNVMQVTFPQ GVNERGLTLD GFLFLNTRLI EEARIQTLWT MLRKFGYSND LRLGDDLVPY 301: SSFKRQADQS VELTNVAIEF LREVYEFFDS NGDNNLEPHE MGYLFETAPE SPWTKPLYKD VTEENMDGGL SLEAFLSLWS LMTLIDPPRS LEYLMYIRFP 401: SDDPSSAVRV TRKRVLDRKE KKSERKVVQC FVFGPKNAGK SALLNQFIGR SYDDDSNNNN GSTDEHYAVN MVKEPGVISD TDKTLVLKEV RIKDDGFMLS 501: KEALAACDVA IFIYDSSDEY SWNRAVDMLA EVATIAKDSG YVFPCLMVAA KTDLDPFPVA IQESTRVTQD IGIDAPIPIS SKLGDVSNLF RKILTAAENP 601: HLNIPEIESK KKRSCKLNNR SLMAVSIGTA VLIAGLASFR LYTARKQS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)