AT3G03470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:endoplasmic reticulum 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : cytochrome P450, family 87, subfamily A, polypeptide 9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of CYP89A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
cytochrome P450, family 87, subfamily A, polypeptide 9 (CYP89A9); FUNCTIONS IN: electron carrier activity, monooxygenase activity, iron ion binding, oxygen binding, heme binding; INVOLVED IN: response to cyclopentenone; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cytochrome P450 (InterPro:IPR001128), Cytochrome P450, conserved site (InterPro:IPR017972), Cytochrome P450, E-class, group I (InterPro:IPR002401); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cytochrome P450, family 87, subfamily A, polypeptide 6 (TAIR:AT1G64940.1); Has 30488 Blast hits to 30273 proteins in 1588 species: Archae - 47; Bacteria - 2858; Metazoa - 11557; Fungi - 5907; Plants - 9145; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 974 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:824692..826345 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59258.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 511 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEITTIIFLI ISSLTFSIFL KLIFFFSTHK LPPGPPRFPV IGNIIWLKKN NFSDFQGVLR DLASRHGPII TLHVGSKPSI WVTDRSLAHQ ALVQNGAVFS 101: DRSLALPTTK VITSNQHDIH SSVYGSLWRT LRRNLTSEIL QPSRVKAHAP SRKWSLEILV DLFETEQREK GHISDALDHL RHAMFYLLAL MCFGEKLRKE 201: EIREIEEAQY QMLISYTKFS VLNIFPSVTK FLLRRKWKEF LELRKSQESV ILRYVNARSK ETTGDVLCYV DTLLNLEIPT EEKEGGKKRK LSDSEIVSLC 301: SEFLNAATDP TATSMQWIMA IMVKYPEIQR KVYEEMKTVF AGEEEEREEI REEDLGKLSY LKAVILECLR RHPPGHYLSY HKVTHDTVLG GFLIPRQGTI 401: NFMVGEMGRD PKIWEDPLTF KPERFLENGE ACDFDMTGTR EIKMMPFGAG RRMCPGYALS LLHLEYYVAN LVWKFEWKCV EGEEVDLSEK QQFITMVMKN 501: PFKANIYPRR K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)