AT3G02910.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.997 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : AIG2-like (avirulence induced gene) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
AIG2-like (avirulence induced gene) family protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Butirosin biosynthesis, BtrG-like (InterPro:IPR013024), AIG2-like (InterPro:IPR009288); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: AIG2-like (avirulence induced gene) family protein (TAIR:AT5G46720.1); Has 320 Blast hits to 319 proteins in 102 species: Archae - 4; Bacteria - 64; Metazoa - 146; Fungi - 0; Plants - 79; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 27 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:649986..650549 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21285.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.61 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 187 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGHETMTPAT TTLVFTYGTL KRGFSNHVLM QDLIRSGDAS FKGVYQTLDK YPLVCGPYRV PFLLNKPGSG YHVNGELYAV SPRGLSRLDE LEGISRGHYI 101: RQPIRLAAAE EEEEEEGDLE TEAPSSCVVE AYYAHKSYEE ELWRRNRGRS FGAYTENEAR GYVKRNDRPQ HLSFLDHIRI FVSSPCD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)