AT3G02870.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Inositol monophosphatase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a L-galactose-1-phosphate phosphatase, involved in ascorbate biosynthesis. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
VTC4; FUNCTIONS IN: 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase activity, L-galactose-1-phosphate phosphatase activity, inositol or phosphatidylinositol phosphatase activity, inositol-1(or 4)-monophosphatase activity; INVOLVED IN: sulfur metabolic process, L-ascorbic acid biosynthetic process, response to karrikin, response to cold, inositol biosynthetic process; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inositol monophosphatase, conserved site (InterPro:IPR020550), Inositol monophosphatase (InterPro:IPR000760), Inositol monophosphatase, metal-binding site (InterPro:IPR020583), Inositol monophosphatase, Lithium-sensitive (InterPro:IPR020552); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: myo-inositol monophosphatase like 1 (TAIR:AT1G31190.1); Has 16249 Blast hits to 16237 proteins in 2366 species: Archae - 250; Bacteria - 8645; Metazoa - 648; Fungi - 322; Plants - 290; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6094 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:627742..629682 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 29123.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 271 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADNDSLDQF LAAAIDAAKK AGQIIRKGFY ETKHVEHKGQ VDLVTETDKG CEELVFNHLK QLFPNHKFIG EETTAAFGVT ELTDEPTWIV DPLDGTTNFV 101: HGFPFVCVSI GLTIGKVPVV GVVYNPIMEE LFTGVQGKGA FLNGKRIKVS AQSELLTALL VTEAGTKRDK ATLDDTTNRI NSLLTKVRSL RMSGSCALDL 201: CGVACGRVDI FYELGFGGPW DIAAGIVIVK EAGGLIFDPS GKDLDITSQR IAASNASLKE LFAEALRLTG A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)